Artemis Fowl, seorang kriminal muda yang berbakat, memburu perkumpulan rahasia peri untuk menemukan ayahnya yang hilang . Di pantai Irlandia, hiruk-pikuk media terjadi di Fowl Manor, tempat koleksi peninggalan terkenal di dunia yang dicuri dikaitkan dengan pengusaha kaya, Artemis Fowl . Ditangkap di istana, Mulch Diggums diinterogasi oleh intelijen Inggris dan mengklaim bahwa majikannyatelah mencuri "Aculos" yang kuat . Menawarkan untuk membuktikan keberadaan sihir, Diggums menceritakan kisah Artemis Fowl, Jr . Tiga hari sebelumnya, Artemis, seorang jenius berusia 12 tahun, tinggal di Fowl Manor bersama ayahnya yang janda, Artemis Sr. dari pencurian beberapa artefak tak ternilai yang ditemukan di atas kapal . Artemis Jr menerima panggilan dari sosok berkerudung . Sambil menahan ayahnya, sosok berkerudung itu memberi Artemis waktu tiga hari untuk memulihkan Aculos, yang telah dicuri dan disembunyikan Artemis Sr . Domovoi "Dom"Butler, pengawal Artemis', menunjukkan kepadanya perpustakaan tersembunyi tempat generasi Fowl menyimpan katalog bukti keberadaan makhluk ajaib . Jauh di bawah tanah di Kota Haven - rumah bagi peradaban peri - Mulch, pencuri kurcaci berukuran besar, bertemu dengan LowerPetugas pengintaian Polisi Elemen (LEPrecon) Holly Short saat dia dibawa ke penjara . Komandan Julius Root mengirimkan pasukan LEPrecon untuk mencari Aculos, sumber daya peri' terbesar . Foaly, penasihat teknis centaur LEPrecon, menemukanmakhluk tidak sah telah muncul ke permukaan .

Holly dikirim untuk menyelidiki, terlepas dari kenyataan bahwa ayahnya, Beechwood Short, mencuri Aculos dan dibunuh . Di Martina Franca, Italia, Holly turun tangan sebagai troll nakal dan menyerang pesta pernikahan manusia . Menggunakan "waktu membeku", LEPrecon menundukkan troll dan menghapus ingatan manusia' . Keponakan Dom' yang berusia 12 tahun, Juliet, tiba di istana . Dari jurnal ayahnya, Artemis mengetahui bahwa Beechwood membawa Aculos ke Artemis Sr . ke jadilah Opal Koboi, peri yang berencana memusnahkan umat manusia . Artemis mengirim Dom untuk mengintai Bukit Tara . Holly, bertekad membersihkan nama ayahnya, tidak mematuhi perintah dan terbang ke Bukit Tara, di mana dia menemukan ID Beechwood dipenjara di dalam manor . Root dan pasukan petugas LEPrecon menyegel Fowl Manor dalam waktu yang membeku, tetapi Artemis dan Dom melawan mereka menggunakan peralatan Holly . Artemis menuntut Aculos sebagai imbalan atas pembebasan Holly, melarang peri memasuki rumahnya masih hidup . Terikat oleh aturan peri, Root mengambil Mulch dari penjara, menawarinya pengurangan hukuman untuk menyusup ke Fowl Manor . Terowongan Mulch di dalam dan menerobos brankas Artemis Sr . ', menemukan Aculos, sementara Artemis membebaskan Holly dan meminta bantuannya Briar Cudgeon, mata-mata Koboi, mengambil alih komando LEPrecon dan melepaskan troll yang ditangkap ke dalam rumah, memasukkan semua sihir ke dalam .

Mulch menelan Aculos saat Artemis, Holly, Juliet, dan Dom menghindari troll tersebut, yang ditundukkan . Mendorong Artemis keluar cara, Dom terluka parah . Melawan perintah, rekan perwira Holly membuka blokir sihirnya, dan dia menghidupkan kembali Dom . Mulch dan pasukan LEPrecon melarikan diri saat pembekuan waktu runtuh . Ditinggal bersama Aculos, Artemis menolak memberikannya kepada Koboi, dan menyelamatkan ayah Artemis' . Saat Koboi mencoba membunuh Artemis Sr ., Holly memanggilnya ke Fowl Manor . Artemis Sr . memberi tahu Holly bahwa ayahnya memberikan nyawanya untuk melindungi Aculos, memberinya daftar kaki tangan Koboi' . Holly mengembalikan Root, yang kembali memegang komando, mengarahkannya untuk menyelidiki setiap nama dalam daftar . Artemis memanggil Koboi, berjanji untuk mengejarnya . Interogator Mulch menawarinya kebebasan sebagai imbalan atas bantuan menangkap Artemis Sr ., tetapi Mulch mengungkapkan bahwa Artemis mengatur penangkapannya buktikan kejadian tersebut kepada pihak berwenang, dan konfirmasikan adanya sihir di kamera . Saat interogator meminta bantuan, helikopter Fowl' menyelamatkan Mulch dan, bergabung dengan Holly, mereka terbang .