Sebagai imbalan atas kebebasannya, pemburu hadiah Jonah Hex harus melacak seorang teroris dengan senjata super . Selama masa kepresidenan Grant, Jonah Hex adalah pemburu hadiah yang tak kenal belas kasihan . Dalam Perang Saudara, dia adalah seorang pemberontak yang kehormatannya membuatnya bertabrakan dengan seorang jenderal Konfederasi, Quentin Turnbull, yang membunuh keluarga Jonah sementara Jonah mengawasi . Sebagai akibat dari cacat dan dia dapat berbicara dengan orang mati . Setelah merencanakan kematiannya sendiri, Turnbull, bersama sekelompok pendukung pemberontak, menyusun rencana untuk membuat Uni bertekuk lutut . Grant ingin Hex menghentikannya . Sementara negara bersiap merayakan Hari Kemerdekaan sekutu yang tidak mungkin punya sedikit waktu untuk menghentikan Turnbull dan senjata pemusnah massalnya . — Selama Perang Saudara Amerika, Jonah Hex (Josh Brolin) bertempur di pihak Konfederasi sampai mengkhianati komandannya, Quentin Turnbull (John Malkovich) untuk menyelamatkan rumah sakit dan membunuh putra Turnbull dalam prosesnya . Turnbull yang pendendam dan haknya- laki-laki, Burke (Michael Fassbender), membakar rumah Jonah bersama istrinya Cassie dan putranya Travis masih di dalam dan mencap wajahnya dengan besi panas, meninggalkan inisial QT; Orang Amerika menemukan Jonah dan menghidupkannya kembali dengan kekuatan mistis mereka . Hasilnya, Jonah hadir di antara yang hidup sementara juga hadir di sisi lain, memberinya kemampuan untuk bangkit sementara dan berkomunikasi dengan orang mati .

Akhirnya mendengar tentangTurnbull tampak mati dalam kebakaran hotel, Jonah membuktikan dirinya sebagai pemburu hadiah legendaris . Jonah berkendara ke kota Stunk Crick dan memberikan hadiah terbarunya kepada petugas kota hanya untuk menyadari bahwa mereka tidak berniat membayar, melainkan membunuh Jonah untuknya.hadiahnya sendiri . Jonah membunuh para marshal dan beberapa pria bersenjata dan pergi . Sementara itu, kereta Union dirampok dari komponen senjata yang diangkut untuk diamankan . Burke meledakkan kereta dan Turnbull, dalam keadaan hidup dan sehat, memerintahkan komponen tersebut dibawa ke FortKebangkitan . Presiden Grant (Aidan Quinn) diberitahu tentang pembantaian kereta api oleh Letnan Grass (Will Arnett) dan menduga bahwa Turnbull berencana menyerang Union pada tanggal Empat Juli (seratus tahun negara itu) . Grass diberitahu untuk menemukan Jonah dan mempekerjakannya Turnbull . Jonah pergi ke rumah bordil dan menghabiskan malam bersama Lilah (Megan Fox), seorang pelacur yang tertarik pada pria cacat itu karena lebih dari sekadar kepentingan profesional . Saat Jonah bersiap untuk berangkat keesokan paginya, para pria Grasss menyerbu masuk dan memberi tahu Jonah bahwa dia wajib militer ke dinas negara untuk melacak Turnbull . Menyadari keluarganya masih belum terbalaskan, Jonah menerima . Di tempat lain, Turnbull dan Burke mengambil komponen utama senjata pembunuh negara, sebuah bola kimia oranye yang dikembangkan oleh Eli Whitney untuk melayaniUnion .

Grass memberi tahu Jonah semua yang diketahui tentang rencana Turnbull tetapi menjelaskan bahwa jejaknya terhenti karena informan mereka meninggal . Membangkitkan informan dengan kekuatannya, Jonah mengetahui bahwa pria itu tidak direkrut oleh Turnbull, tetapi oleh Kolonel Slocum (TomWopat), rekan Jonah lainnya yang mengkhianati keluarganya . Jonah mengunjungi Slocum di paviliun pertandingan kematian ilegal yang dijalankan oleh Doc Cross Williams (Michael Shannon) . Slocum korup dan dengan sinis menyuruh Jonah untuk menanyakan kematian putra Turnbull, Jeb, di mana miliknya . Jonah melempar Slocum ke arena pertarungan tempat gladiator, makhluk buas seperti ular, menyerang dan membunuhnya . Jonah berkendara ke Gettysburg di mana dia menghabiskan malam menggali Jeb Turnbull (Jeffrey Dean Morgan) dan menghidupkan kembali mayatnya . Setelah beberapa saatkonfrontasi, Jonah meminta maaf karena membunuh Jeb selama Perang Saudara . Sebagai imbalannya, Jeb memberi tahu Jonah tentang Fort Resurrection dan kemudian kembali ke akhirat . Jonah kemudian membeli beberapa persenjataan baru dari Smith (Lance Reddick), seorang pembuat senjata, dalam persiapan untuk pertempuran . Smithmenunjukkan bahwa kebencian Jonah terhadap Persatuan tidak lahir dari kesetiaan Selatan tetapi dari kekeraskepalaan untuk mematuhi aturan pemerintahan . Jonah pergi ke benteng dan bertemu Turnbull tetapi tidak mendapat kesempatan untuk membunuhnya . Jonah tertembak beberapa kali setelahnya bertarung dengan Burke tetapi mampu melarikan diri .

Saat Jonah mendekati kematian dan membayangkan bagaimana rasanya melawan Turnbull, anjingnya menyeretnya ke sekutu penduduk asli Amerika yang melakukan upacara yang menyembuhkan Jonah . Kembali berdiri, dia menyampaikan pesan Turnbull berencana untuk menghancurkan ibu kota . Setelah itu, Turnbull memberitahu Burke untuk menemukan apa yang disukai Jonah dan membawanya sebagai umpan untuk Jonah; menyerang . Burke menyerangnya dan keduanya diam-diam bertarung sampai Jonah mendorong Burke terlebih dahulu ke motor perahu, lalu menghancurkannya dengan membakarnya . Jonah bersiap untuk menembak Turnbull tetapi Turnbull menahan Lilah di bawah todongan senjata dan memaksa Jonah untuk menyerah .Turnbull merantai Jonah dan Lilah di palka kapal dan memberi tahu Jonah bahwa dia ingin dia menyaksikan saat Persatuan dihancurkan . Lilah mengambil borgolnya dan membebaskan Jonah, yang mengejar Turnbull . Lt . Kapal perang pemantau rumput menyerang Turnbull tetapi dihancurkan dengan Pembunuh Bangsa . Jonah dan Turnbull bertarung dan jatuh ke ruang mesin . Turnbull unggul dan memberi perintah untuk menghancurkan kota . Saat senjata awal ditembakkan, mempersiapkan pemicu ledakan, Jonah menggunakan tomahawknya untuk menghentikan serangan.meriam . Dia kemudian secara brutal mengalahkan Turnbull dan menjebak lehernya dengan roda gigi sebelum menyelamatkan Lilah . Pasangan itu melompat ke dalam air tepat saat bola kimia menyala di ruang mesin, membunuh Turnbull dan semua anak buahnya .

Keesokan harinya, Grant menghadiahi Jonah dengan sheriff Amerika Serikat . Jonah menolak, namun meyakinkan Presiden bahwa jika mereka membutuhkannya, mereka akan dapat menemukannya .