Setelah terungkapnya Insurgent yang menggemparkan dunia, Tris harus melarikan diri bersama Four melewati tembok yang mengelilingi Chicago, untuk akhirnya menemukan kebenaran mengejutkan dari dunia di sekitar mereka . Setelah pengungkapan "Insurgent" yang menggemparkan dunia, Tris harus melarikan diri bersama Four dan melampaui tembok yang melingkupi Chicago, meninggalkan untuk pertama kalinya satu-satunya kota dan keluarga yang pernah mereka kenal . Begitu berada di luar, pengungkapan kebenaran baru yang mengejutkan dengan cepatmembuat penemuan lama menjadi tidak berarti, dan Tris dan keempatnya harus segera memutuskan siapa yang dapat mereka percayai saat pertempuran kejam terjadi di luar tembok Chicago yang mengancam seluruh umat manusia . Untuk bertahan hidup, Tris terpaksa membuat pilihan mustahil tentang keberanian, kesetiaan,pengorbanan, dan cinta . —mapbryan Banyak warga Chicago berlari ke arah tembok, tetapi tentara di bawah Evelyn (Naomi Watts) diberitahu untuk menutup perimeter, dan dengan demikian, tidak ada yang diizinkan lewat . Evelyn mengarahkan Jack Kang (Daniel Dae Kim) dari Candor untuk mengadakan persidangan bagi Erudite di mana beberapa di antaranya menjadi eksekusi, dimulai dengan Max (Mekhi Phifer) . Evelyn dan Johanna (Octavia Spencer) (Leader of Amity) berupaya menekan Tris (Shailene Woodley) dan Four (Theo James) untuk mengambil posisi kepemimpinan di organisasi baru. menolak .

Johanna tidak mendukung eksekusi yang dilakukan Evelyn dan meninggalkan markas bersama sesama pengikut Amity . Setelah melihat situasi permusuhan di dalam kota hanya akan bertambah buruk, Tris melarikan diri bersama Four, Caleb (Ansel Elgort),Christina (Zoe Kravitz), Tori (Maggie Q), dan Peter (Miles Teller) melakukan perjalanan melewati tembok yang mengelilingi Chicago . Namun, Tori dibunuh oleh Edgar (Jonny Weston) dalam upayanya . Kelompok tersebut disergap oleh Edgar, yang dan kapal udara . Para tentara membawa kelompok tersebut ke Biro Kesejahteraan Genetik, sebuah kota yang sangat maju di mana mereka mengetahui bahwa bertahun-tahun yang lalu pemerintah percaya bahwa masalah masyarakat disebabkan oleh "gen yang rusak" . Dalam upaya untuk menciptakan masyarakat yang lebih baik, memodifikasi gen manusia, dengan akibat yang sangat buruk . Pemerintah melakukan "eksperimen" dalam upaya memperbaiki kesalahan ini, dengan membangun kota-kota terpencil di sisa-sisa Amerika Serikat . Harapannya adalah untuk menghasilkan cukup banyak individu Divergen yang murni secara genetik untuk memperbaikinya"kerusakan genetik" yang tersisa setelah Perang Kemurnian . Tris dan Four diuji oleh Matthew (Bill Skarsgård) dan Nita (Nadia Hilker) untuk memverifikasi dan mempelajari Divergensi mereka . Tris terbukti benar-benar Divergen, tetapi Four's masih "rusak" . Caleb dan Peter ditugaskan ke tim pengawasan yang memantau Chicago .

Matthew kemudian membawa Tris ke pemimpin Biro, David (Jeff Daniels) . David memberi Tris sebuah perangkat yang memungkinkannya melihat kenangan ibunya dan diselamatkan dan diadopsi oleh Biro sebelum secara sukarela bergabung dengan eksperimen Chicago karena dedikasinya pada proyek tersebut . Sebagai imbalan atas bantuannya dalam memulihkan perdamaian di Chicago, Tris setuju untuk membantu David, yang mengklaim bahwa hanya dewan yang dia laporkan yang memiliki kekuasaan campur tangan . Sementara itu, Four dan Christina berlatih bersama Nita dan bergabung dengan pasukan militer Biro . Mereka bergabung dengan militer dalam misi penyelamatan ke desa gurun terdekat, meskipun Four menjadi tidak mempercayai niat Biro setelah menyadari bahwa mereka akan pergidi sana untuk menculik dan secara paksa mengintegrasikan anak-anak ke dalam populasi Biro. . Sekembalinya mereka, Four diam-diam mengajukan petisi kepada Caleb untuk mengawasi situasi di Chicago . Four juga berupaya memperingatkan Tris tentang niat Biro, namun dia menolak gagasannya memperingatkan Four tentang konflik yang meningkat dengan cepat di Chicago antara kelompok Allegiant Johanna dan Evelyn tanpa faksi, dengan perang terbuka menjadi ancaman yang akan segera terjadi . Four memohon kepada Tris agar dia kembali ke Chicago bersamanya untuk mengakhiri pertumpahan darah, pergi bersama David ke Providence untuk bertemu dengan dewan .

David setuju untuk memasukkan kembali Four kembali ke Chicago, dikawal oleh Matthew dan beberapa tentara Biro . Setelah di udara, Matthew diam-diam mengungkapkan kepada Four bahwa penerbangan itu adalah jebakan, dan dia dimaksudkan untuk pecah dan Four mengalahkan semua tentara, meskipun pesawat itu jatuh sebagai akibatnya . Matthew mengkhianati David dengan membantu Four melewati dinding jubah . Four melanjutkan ke Chicago sementara Matthew tetap di belakang untuk diselamatkan oleh Biro dan memperingatkan Tris . Sementara itu,Tris dan David bertemu dengan dewan . Tris tidak setuju dengan tujuan dewan dan mengkritik bagaimana mereka tidak melakukan apa pun untuk menghentikan kekerasan di Chicago . Dewan menjawab bahwa David memiliki kekuatan untuk campur tangan kapan pun dia mau, mengungkapkan bahwa dia telah berbohongkepadanya dari awal . Selama penerbangan kembali ke Biro, Tris mengakhiri kemitraan mereka . Sekembalinya, dia mengumpulkan Caleb dan Christina di pesawat David's untuk kembali ke Chicago, dan Nita membantu mereka melarikan diri . Empat ditangkap oleh faksi Evelyn untuk mengakhiri kekerasan meskipun dia tidak menunjukkan niat untuk mundur . Tris, Caleb, dan Christina tiba dan menemukan kota itu terkoyak pada tahap pembukaan serangan penuh oleh Allegiant .

David membuat kesepakatan dengan Peter sebagai ganti Peter promosi dan memasukkannya ke Chicago untuk meyakinkan Evelyn agar mengerahkan timbunan gas Biro yang tersembunyi untuk menghapus ingatan para penyerang dan memaksakan perdamaian yang menguntungkannya, yang dengan enggan dia setujui . Peter membawanya ke lemari besi tempat dia dapat menyebarkan gas kota tetapi tetap aman, menjadikannya satu-satunya individu di Chicago yang akan mengingat peristiwa-peristiwa itu . Tris dan Christina bertarung melalui faksi tanpa faksi dan tiba di lemari besi, setelah menyelamatkan Empat di sepanjang jalan . Di pintu lemari besi, Empat untuk menghentikan serangan gas, karena dia tidak akan ingat siapa dia jika dia melakukannya . Dia melipat dan menghentikan pelepasan dan ditembak oleh Peter yang frustrasi . Peter menyombongkan kemenangannya sampai gas yang sama mulai terlepas di dalam lemari besi sebagai mengkhianatinya, Peter membuka lemari besi sehingga Tris dan Four dapat menghentikan pelepasan gas dan melarikan diri kembali ke dinding jubah, karena Four mengatakan dia akan membuat dia membayar karena melukai ibunya. Caleb datang dan membantu Tris menghancurkan pusat penyebaran gas, . Karakter utama berkumpul di atas gedung Erudite saat mereka menyaksikan pesawat ulang-alik curian terbang kembali menuju Biro, penuh dengan bahan peledak .

Tris mengirimkan pesan ke seluruh kota, mengungkapkan kepada mereka keberadaan Biro dan bahwa Chicago adalah sebuaheksperimen Murni . Pesannya kepada Biro adalah bahwa Chicago bukan lagi eksperimen mereka, tetapi rumah warganya . Caleb meledakkan bahan peledak di akhir pesan, membuat lubang besar di dinding jubah dan mengungkap kedua kota tersebut satu sama lain . Film berakhir dengan karakter Chicago menatap Biro di kejauhan, dengan David berdiri di belakang Tris melalui mesinnya, memelototinya .